孙姓的来源主要有三个，分别出自姬姓、芈姓和妫姓。
西周初年，武王姬发封其同母弟康叔于卫（今河南淇县）。卫康叔的8世孙卫武公有个儿子叫惠孙，惠孙的孙子名乙，字武仲，他以祖父的字命氏，即孙氏。此为姬姓之孙。
春秋初期，楚国王族、名相孙叔敖（芈氏，名敖，字孙叔），刚正清廉，死后其子生活困难。楚庄王听说后把寝丘（今河南沈丘县西南）的一块地赐给孙叔敖的儿子。孙叔敖的儿子以父字为姓，奉孙叔敖为孙姓始祖。因楚国的祖先为芈姓，故称此支孙氏为芈姓之孙。
妫姓之孙出自春秋时齐景公的大夫陈无宇。他是从陈国逃到齐国的陈公子完的4世孙。无宇之子书，字子占，因功被齐景公赐姓孙氏，封于乐安（今山东博兴县）。后因乱，孙书之孙孙武逃到吴国为将，举世闻名的《孙子兵法》即孙武所著。孙武的后代孙膑也是著名的军事家，著有《孙膑兵法》。
