1、个体生病，如果是单独的鲸鱼搁浅，那么疾病和受伤起主要作用，自身疾病导致回声定位系统失灵，而受伤衰老致使鲸鱼太过虚弱，自然死亡冲上海滩。
2、导航失灵，一条巨鲸的眼睛只有一个小西瓜那样大，且视力极度退化，一般只能看到17米以内的物体。鲸鱼交流和寻找猎物时，靠声音来导航的，也就是回声定位。鲸鱼就根据这种超声波的往返时间来准确地判断自己与障碍物的距离。在很浅的海湾区域，回声定位就没有那么灵了，难以找到方位，最后就进入浅水区搁浅了。
3、军用声呐，人类军用声呐产生的噪音也会对鲸鱼们进行干扰，惊吓到鲸鱼，让它们异常加速浮上水面，进而导致它们搁浅死亡。研究证实，鲸鱼会躲避海军用来侦测潜水艇的军用声纳。最常见的搁浅鲸类喙鲸对声纳非常敏感，其生性害羞，常误以为噪音是杀人鲸发出的声音而受到惊吓搁浅。
4、羊群效应，鲸鱼由于一些鲸本身是社会性动物，和羊群一样，也是有一只领头的鲸，如果领头鲸迷路了搁浅之后，其余鲸想要救援这条已经搁浅的鲸，，它们一心想要救援，却忽略了自身的安全，于是，鲸群体搁浅的现象就出现了。就很容易发生大规模群体搁浅行为。
5、环境污染，科学家曾在解剖鲸鱼时，发现它们的胃里有塑料袋、人字拖、塑料杯等等塑料制品，这些东西很可能导致鲸鱼无法进食，从而造成其搁浅行为。此外，污染海水的化学物质也可能扰乱鲸鱼的感觉系统，造成鲸鱼搁浅。
