1、存在岩石中：
石化化石：动植物体内若干坚硬构造(如生物的硬壳或骨胳)为矿物所取代而成。
大部分的化石为此种化石。一般多为水生生物的遗骸。因陆地上的生物死亡后，其易因风化作用破坏或其它生物的吞食腐化与分解，而水生的遗骸，常能迅速为沉积物所覆盖，而减缓腐化分解的速度，故坚硬部分再经物理化学作用，便可形成化石。
2、存在琥珀中：琥珀是松树所分泌的树脂经硬化而成，树脂是柔软而有粘性的物质，生物常易陷入而被包埋其中，树脂遂渗入体内，硬化后生物遗骸便成为化石。
3、存在冰层中：保存在冰层中的生物尸体，可长久不腐坏。如西伯利亚冰层中的猛马遗体。但此种情形殊为少见。
4、干燥：生物死后，遗骸再非常干燥的洞中脱水而干燥不腐使遗骸得以保存下来。如车诺比尔核能发电场因发生核子灾变10年后85年4月12日七大工业国与俄罗斯共八个国家的研究人员，持一个畸形的胎儿公布世界。
5、其它如火山灰会覆盖生物及沥青会使生物陷溺其中，亦有助于化石的形成。
1。动物的尸体沉入海底，慢慢被沉积物覆埋;
2。较低层的沉积岩变成化石，动物遗骸也硬化成化石;
3。岩石发生褶曲并受到侵蚀;
4。化石暴露出地表。
