1、建造标准差异：四合院有标准的规格和形状，合院是一种内院式住宅，其特点是庭院周围建有房屋，并将庭院围起，一般来说，合院可分为二合院、三合院、四合院等类型。而别墅可以多种多样，没有过多造型上的要求。
2、地域的区别：四合院只有中国华北地区有，别墅中外到处都有。四合院的院子在里边，别墅的院子在外边，四合院是单层的平房，别墅是多层的楼房，别墅即别业，是居宅之外用来享受生活的居所，是第二居所而非第一居所，而四合院是祖祖辈辈居住的地方。
3、用途的区别：别墅即别业，是居宅之外用来享受生活的居所，是第二居所而非第一居所，而四合院是祖祖辈辈居住的地方。
4、居住隐秘性不同：合院介于联排与独栋之间，主要是隐私性比联排别墅好点，但还是比不上独栋别墅。
