公元产生于基督教盛行的六世纪，当时，为了扩大教会的统治势力，僧侣们把任何事情都附会在基督教上。公元525年，一个叫狄奥尼西的僧侣，为了预先推算七年后(即公元532年)复活节的日期，提出了所谓耶稣诞生在古罗马的狄奥克列颠纪元之前284年的说法，并且主张以耶稣诞生之年作为起算点的纪元，这个主张得到了教会的大力支持。
公元532年，教会把狄奥克列颠纪年之前的284年作为公元元年，并将此纪年法在教会中使用。到1582年罗马教皇制定格里高利历时，继续采用了这种纪年法。由于格里高利历的精确度很高，而为国际通用，所以被称为公历。从此，教士所臆造的耶稣诞生的年份便被称为公元元年。所谓公元，就是公历纪元。
由于公元纪年的起点是公元1年，而没有公元0年，所以大多数对公元纪年有充分了解的科学家和世界上大多数权威天文机构，都明确支持21世纪始于2001年的说法。
