蚊子的幼虫称为孑孓。孑孓用吸管呼吸。摄食有机物及微生物，口的刷毛会产生水流，流向嘴巴。这个时期约维持10～14天，经4次蜕皮后变成蛹。
初孵出的幼虫长约1.5mm，幼虫共分四龄。经3次蜕皮，成为第四龄幼虫时，体长可较第一龄幼虫增长8倍。幼虫体分为头、胸、腹3部，各部着生毛或毛丛。头部有触角、复眼、单眼各1对，口器为咀嚼式，两侧有细长密集的口刷，借助口刷的迅速摆动以摄取水中的食物。
胸部略呈方形、不分节。腹部细长，可见9节。前7节形状相似，第8节背面有气孔器与气门或细长的呼吸管，是幼虫期分类的重要依据。库蚊呼吸管细长，伊蚊呼吸管粗短;按蚊缺呼吸管，但有气门，各腹节背面有掌状毛，有漂浮作用。在气温30℃和食物充足的条件下，幼虫期经约5～8天发育，蜕皮4次变为蛹。
