目前关于舍利子形成原因没有科学解释，只流行以下三种传言：
1、饮食习惯，有认为舍利子的形成是由于僧人长期素食，摄入了大量纤维素和矿物质，经过人体的新陈代谢，极易形成大量的磷酸盐、碳酸盐等，最终以结晶体的形式沉积于体内而形成。
2、人体骨骼残余，人体骨骼在烧灼时可能会出现各种形状的重结晶现象。人体有很多细小骨骼如指骨、趾骨，少量骨骼经燃烧后因重结晶而产生结晶外观的“舍利”。这种可能性是存在的。
3、人体结石，有人将舍利子解释为结石。人体的结石中，胆结石的主要成分是大分子有机物和少量碳酸钙。经焚烧结石成舍利。
