1、上课方式不同
全日制研究生是属于周一到周五全日制脱产学习的，在职研究生属于非脱产学习，而在职研究生上课方式主要有3种，周六日上课、假期集中上课、网络教学，和工作时间是没有冲突的。
2、人群不同
全日制研究生，面对的主要是大学生，一般多是大三或大四即将毕业的学生，在时间和精力上都相对比较充沛。在职研究生，从名词上就可以看出这是面对在职人群的，但也不仅仅针对在职人员，待业青年、毕业大学生、自由职业人也都可以报考。
3、学费不同
从学费方面看，全日制学硕一般是8000左右，重点大学基本学术硕士免学费，全日制专硕略高;非全日制要高于全日制，非全日制专硕更高，一万到几万不等，有的甚至是十几万。全日制研究生有各种形式的奖助学金，名校奖助学金更高，一般提供住宿，需要把户口档案转到学校;非全日制研究生一般没有奖助学金，一般不解决住宿，户口档案一般不转。
4、证书不同
在职研究生拿到的硕士学位证书是和全日制研究生一样的，并无区别。但在职研究生的学历证书与全日制会有区别，其学历证书上会注明“非全日制”，全日制研究生的学历证书上会注明“全日制”来区分。不过，国家的政策还是明确规定了“其学历学位证书具有同等法律地位和相同效力”，在职研究生的证书的含金量还是蛮高的。
